More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0816 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  67 
 
 		 305 aa  411  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  65.77 
 
 		 303 aa  401  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  67.11 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  65.1 
 
 		 309 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.01 
 
 		 297 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.49 
 
 		 299 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5035  pyruvate carboxyltransferase  52.36 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  49.66 
 
 		 315 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1588  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.34 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1612  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.34 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1558  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.66 
 
 		 301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.953041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  51.36 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.32 
 
 		 319 aa  285  7e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  49.49 
 
 		 314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  50.68 
 
 		 313 aa  281  8.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  49.83 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  46.8 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1894  pyruvate carboxyltransferase  49.33 
 
 		 301 aa  279  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  51.19 
 
 		 325 aa  278  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  49.17 
 
 		 313 aa  278  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4266  pyruvate carboxyltransferase  50.32 
 
 		 317 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0273285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  50.34 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4466  pyruvate carboxyltransferase  50.34 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  48.01 
 
 		 320 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  48.01 
 
 		 320 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  46.96 
 
 		 317 aa  275  9e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.15 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  46.1 
 
 		 321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  48.98 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  47.84 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  51.5 
 
 		 308 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  51.16 
 
 		 311 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.33 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.83 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  46.74 
 
 		 301 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  47.02 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  49.83 
 
 		 308 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.69 
 
 		 303 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.03 
 
 		 303 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  47 
 
 		 301 aa  265  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  46.42 
 
 		 296 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  45.36 
 
 		 301 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.34 
 
 		 303 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.13 
 
 		 308 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  47.59 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.94 
 
 		 313 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  47.68 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  46.23 
 
 		 296 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  47.46 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.34 
 
 		 303 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.69 
 
 		 303 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.28 
 
 		 336 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  46.64 
 
 		 311 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.34 
 
 		 303 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.34 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.34 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.34 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.34 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  45.52 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3038  pyruvate carboxyltransferase  46.39 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.928882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3757  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.39 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0122709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.04 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  46.82 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  47.02 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  46.42 
 
 		 296 aa  258  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  47.93 
 
 		 315 aa  258  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  45.61 
 
 		 306 aa  257  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  47.26 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3354  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.8 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.47 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  46.08 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  47.08 
 
 		 296 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.86 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  45.02 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5964  pyruvate carboxyltransferase  45.45 
 
 		 313 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0367175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.24 
 
 		 299 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.32 
 
 		 327 aa  255  8e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  44.86 
 
 		 297 aa  254  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  48.49 
 
 		 309 aa  254  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  46.58 
 
 		 327 aa  254  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  42.91 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  45.51 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  46.44 
 
 		 311 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.82 
 
 		 315 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2126  pyruvate carboxyltransferase  47.47 
 
 		 299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.129667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  48.35 
 
 		 307 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  46.76 
 
 		 306 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.99 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  48.35 
 
 		 307 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2850  pyruvate carboxyltransferase  47.23 
 
 		 307 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  46.18 
 
 		 331 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  47.23 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0348  pyruvate carboxyltransferase  45.3 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.62 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3092  pyruvate carboxyltransferase  44.7 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  0.0987671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  46.18 
 
 		 331 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1715  pyruvate carboxyltransferase  46.97 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>