More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3506 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 315 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  87.1 
 
 		 313 aa  555  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  77.52 
 
 		 309 aa  494  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  63.46 
 
 		 329 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  67.22 
 
 		 321 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  65.47 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  67.11 
 
 		 320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  67.11 
 
 		 320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  65.06 
 
 		 326 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  66.45 
 
 		 320 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  62.86 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  63.46 
 
 		 324 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  65.5 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  60.9 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  65.81 
 
 		 320 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  61.61 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  61.29 
 
 		 331 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  64.26 
 
 		 325 aa  374  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  59.67 
 
 		 326 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  56.69 
 
 		 332 aa  356  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  56.35 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  57.05 
 
 		 308 aa  348  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  54.97 
 
 		 308 aa  342  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  53.55 
 
 		 321 aa  341  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  56.86 
 
 		 306 aa  340  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  55.31 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  56.11 
 
 		 308 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  54.67 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  53.11 
 
 		 311 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  54.79 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  45.52 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.81 
 
 		 299 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.97 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  47.26 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.64 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  44.83 
 
 		 305 aa  248  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.47 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  45.45 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  44.14 
 
 		 315 aa  245  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  45.15 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  46.21 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  41.1 
 
 		 317 aa  241  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  44.33 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  41.96 
 
 		 311 aa  235  8e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  45.52 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  43.85 
 
 		 313 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.56 
 
 		 303 aa  232  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.86 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.51 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  46.52 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  42.81 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0445  pyruvate carboxyltransferase  42.81 
 
 		 312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4807  pyruvate carboxyltransferase  42.28 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5348  pyruvate carboxyltransferase  41.91 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5465  pyruvate carboxyltransferase  39.62 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0487859  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  39.86 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.07 
 
 		 310 aa  218  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  40 
 
 		 296 aa  219  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4804  pyruvate carboxyltransferase  39.94 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.75 
 
 		 729 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  38.91 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5396  pyruvate carboxyltransferase  39.31 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615332  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.07 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.74 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  37.88 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.26 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  37.8 
 
 		 301 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.03 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0402015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2967  pyruvate carboxyltransferase  42.23 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  41.24 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2490  pyruvate carboxyltransferase  42.07 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.387658  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3143  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.41 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1715  pyruvate carboxyltransferase  38.57 
 
 		 315 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2326  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.92 
 
 		 315 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.57 
 
 		 315 aa  215  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  37.54 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  37.54 
 
 		 307 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.41 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.41 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1668  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.92 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2850  pyruvate carboxyltransferase  37.2 
 
 		 307 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  40.34 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6309  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.8 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0040  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.32 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723185  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.13 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.46 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3685  pyruvate carboxyltransferase  42.76 
 
 		 744 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.64 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  37.8 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.46 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.72 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  40.89 
 
 		 313 aa  212  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>