More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3564 on replicon NC_013412
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  47.37 
 
 		 318 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  46.67 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  46.02 
 
 		 315 aa  258  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  46.32 
 
 		 311 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  42.76 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  42.91 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.83 
 
 		 319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  44.98 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.89 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.76 
 
 		 297 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.56 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  45.64 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.75 
 
 		 304 aa  248  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  46.79 
 
 		 308 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  43.62 
 
 		 307 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0049  pyruvate carboxyltransferase  42.21 
 
 		 304 aa  247  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3976  pyruvate carboxyltransferase  41.87 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0304522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  43.25 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.1 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  47.02 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  41.52 
 
 		 321 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  44.33 
 
 		 296 aa  244  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3092  pyruvate carboxyltransferase  41.06 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  0.0987671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1697  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.94 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00979317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3494  pyruvate carboxyltransferase  40.73 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  42.21 
 
 		 327 aa  238  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.48 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  43.54 
 
 		 320 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  43.54 
 
 		 320 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.98 
 
 		 303 aa  235  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.28 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  43.61 
 
 		 325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.55 
 
 		 336 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  41.24 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.28 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  42.76 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.93 
 
 		 303 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.93 
 
 		 303 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.93 
 
 		 303 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.28 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.93 
 
 		 303 aa  231  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.59 
 
 		 303 aa  231  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  42.8 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.44 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  40.14 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.93 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.59 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  38.41 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  40.62 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  41.58 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  42.48 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  41.64 
 
 		 296 aa  229  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 315 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  43.01 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1715  pyruvate carboxyltransferase  40.79 
 
 		 315 aa  227  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  41.92 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2326  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.86 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43357 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  42.11 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  42.81 
 
 		 315 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.86 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1668  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.43 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2863  pyruvate carboxyltransferase  38.23 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  39.86 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  38.97 
 
 		 303 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2390  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.22 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.66 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  40.88 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  40.51 
 
 		 329 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  40.85 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0514  pyruvate carboxyltransferase  38.3 
 
 		 303 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00792422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  39.15 
 
 		 298 aa  221  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  40.85 
 
 		 307 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.79 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  40.85 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.37 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  37.01 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  41.81 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.79 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  38.89 
 
 		 310 aa  218  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  38.52 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2967  pyruvate carboxyltransferase  42.86 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  36.58 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  42.54 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.63 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  37.23 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.59 
 
 		 729 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2850  pyruvate carboxyltransferase  40.14 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1462  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.86 
 
 		 317 aa  215  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3354  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.02 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  38.23 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  37.27 
 
 		 314 aa  215  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  39.5 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.52 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  38.55 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  39.15 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3757  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.01 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0122709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4155  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.51 
 
 		 306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.18 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  38.49 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>