More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1232 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 305 aa  614  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.63 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.97 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.97 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.97 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.97 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.97 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.3 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.63 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.63 
 
 		 303 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.3 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.97 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.02 
 
 		 299 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  48.15 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  47.81 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  47.81 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  47.81 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.67 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  43.75 
 
 		 321 aa  252  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  45.21 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  50.9 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  47.14 
 
 		 303 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.42 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  45.9 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  45.79 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  50.76 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  51.99 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.62 
 
 		 309 aa  242  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  44.86 
 
 		 327 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  47 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  51.99 
 
 		 311 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  44.9 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.62 
 
 		 314 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  46.05 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  45.17 
 
 		 329 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  44.67 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.76 
 
 		 327 aa  238  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  48.16 
 
 		 331 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  48.87 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  47.79 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.01 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.08 
 
 		 326 aa  235  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.48 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  48.12 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  44.53 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.35 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  44.33 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  45.89 
 
 		 309 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  46.69 
 
 		 311 aa  231  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.61 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.52 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0348  pyruvate carboxyltransferase  46.08 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  40.14 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.86 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  46.44 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.5 
 
 		 299 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.97 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  46.52 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  43.64 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  46.05 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0343  pyruvate carboxyltransferase  41.55 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4049  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.09 
 
 		 303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0594588  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  43.68 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  44.52 
 
 		 327 aa  225  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.86 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.75 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  41.58 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.84 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.86 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  44.33 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.75 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2536  pyruvate carboxyltransferase  43.01 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.86 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0455  pyruvate carboxyltransferase  45.93 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  47.35 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  39.38 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  38.74 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2810  pyruvate carboxyltransferase  43.73 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.631686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.98 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  43.15 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2932  pyruvate carboxyltransferase  43.01 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  45.77 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.86 
 
 		 729 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  42.55 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.76 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3685  pyruvate carboxyltransferase  45.67 
 
 		 744 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  45.61 
 
 		 298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0312  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.2 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  44.28 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  45.07 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0153  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.94 
 
 		 311 aa  218  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.84 
 
 		 299 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.12 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2967  pyruvate carboxyltransferase  44.56 
 
 		 331 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  40.4 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  41.43 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.86 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.34 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2780  pyruvate carboxyltransferase  44.44 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  0.241199 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00102  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.94 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>