More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1554 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 325 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  91.59 
 
 		 320 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  91.59 
 
 		 320 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  92.11 
 
 		 321 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  91.26 
 
 		 320 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  88.46 
 
 		 320 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  88.78 
 
 		 320 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  69.03 
 
 		 326 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  65.79 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  62.54 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  63.64 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  67 
 
 		 324 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  64.26 
 
 		 315 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  67 
 
 		 327 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  64.5 
 
 		 313 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  62.67 
 
 		 309 aa  381  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  64.45 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  64.45 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  61.67 
 
 		 326 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  61.39 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  56.62 
 
 		 321 aa  352  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  59.6 
 
 		 308 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  59.6 
 
 		 306 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  58.42 
 
 		 308 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  55.85 
 
 		 311 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  55.78 
 
 		 318 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  59.33 
 
 		 326 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  55.52 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  54.82 
 
 		 308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  53.4 
 
 		 315 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  55.25 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  51.19 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  50.34 
 
 		 315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.62 
 
 		 319 aa  272  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.24 
 
 		 299 aa  271  9e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  48.46 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  47.8 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  46.21 
 
 		 327 aa  268  8.999999999999999e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  49.15 
 
 		 303 aa  262  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  46.06 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.55 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  44.75 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  48.45 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  46.42 
 
 		 314 aa  252  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  45.18 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.02 
 
 		 303 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.34 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.34 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.34 
 
 		 303 aa  242  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  46.1 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.68 
 
 		 303 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.68 
 
 		 303 aa  241  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.68 
 
 		 303 aa  241  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.68 
 
 		 303 aa  241  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.34 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.34 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  43.42 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  41.24 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  42.27 
 
 		 301 aa  235  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.32 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.98 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.98 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.98 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0445  pyruvate carboxyltransferase  49.08 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  43.39 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.96 
 
 		 310 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  42.32 
 
 		 306 aa  225  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  39.65 
 
 		 302 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.61 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.27 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  44.93 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  44.86 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1588  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.12 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  41.2 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1612  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.12 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.48 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.89 
 
 		 299 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.24 
 
 		 299 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.89 
 
 		 299 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  39.3 
 
 		 302 aa  222  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  42.76 
 
 		 296 aa  222  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1101  pyruvate carboxyltransferase  41.92 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0153  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.85 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.99 
 
 		 729 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5396  pyruvate carboxyltransferase  44.69 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615332  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0121  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.58 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5348  pyruvate carboxyltransferase  43.51 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1558  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.78 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.953041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6309  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.92 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  42.07 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.58 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.24 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.58 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.58 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5465  pyruvate carboxyltransferase  44.69 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0487859  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0114  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.24 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2967  pyruvate carboxyltransferase  45.48 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.92 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2773  pyruvate carboxyltransferase  42.75 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>