More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4853 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  100 
 
 		 321 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  96.83 
 
 		 320 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  96.83 
 
 		 320 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  96.51 
 
 		 320 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  93.08 
 
 		 320 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  93.4 
 
 		 320 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  92.11 
 
 		 325 aa  544  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  71.1 
 
 		 326 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  67.44 
 
 		 329 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  66.34 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  67.22 
 
 		 315 aa  411  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  67.44 
 
 		 324 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  63.38 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  66.67 
 
 		 313 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  67.43 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  65.68 
 
 		 331 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  64.33 
 
 		 309 aa  391  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  65.02 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  59.06 
 
 		 332 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  61.33 
 
 		 326 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  57.38 
 
 		 321 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  60.07 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  59.67 
 
 		 306 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  55.7 
 
 		 318 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  55.81 
 
 		 311 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  58.63 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  55.33 
 
 		 312 aa  346  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  54.15 
 
 		 308 aa  339  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  59 
 
 		 326 aa  332  7.000000000000001e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  54.52 
 
 		 315 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.84 
 
 		 309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  49.15 
 
 		 304 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.21 
 
 		 299 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.64 
 
 		 319 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  47.59 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  45.49 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  46.13 
 
 		 303 aa  258  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.71 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  47.12 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  45.08 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  45.08 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  47.47 
 
 		 303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  46.08 
 
 		 314 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  46.23 
 
 		 313 aa  249  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  47.42 
 
 		 305 aa  248  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.16 
 
 		 303 aa  245  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.46 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.46 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.46 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  44.48 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.81 
 
 		 303 aa  241  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.46 
 
 		 303 aa  241  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.81 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.81 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.81 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.46 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.46 
 
 		 303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  42.86 
 
 		 301 aa  235  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  42.44 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  43.29 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  45.45 
 
 		 310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  42.09 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.64 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  41.34 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.3 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.83 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.83 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.64 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.83 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6309  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.25 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.61 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.61 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.52 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  38.72 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.91 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  43.12 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5348  pyruvate carboxyltransferase  43.69 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  45.33 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0445  pyruvate carboxyltransferase  46.74 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  41.44 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.89 
 
 		 299 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.55 
 
 		 299 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  38.14 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  40.07 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  43.62 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4807  pyruvate carboxyltransferase  44.48 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  41.72 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1101  pyruvate carboxyltransferase  40.14 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.62 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  37.8 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0040  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.11 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723185  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4270  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.58 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0153  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.46 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  43.29 
 
 		 311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.24 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.41 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0121  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.61 
 
 		 309 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.22 
 
 		 729 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>