More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2658 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 311 aa  635    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  53.22 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.98 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.71 
 
 		 319 aa  255  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  44.14 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.64 
 
 		 313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  46.34 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.72 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  43.14 
 
 		 304 aa  245  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  43.85 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  40.97 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.72 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  43.11 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  43.62 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  42.96 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  41.96 
 
 		 315 aa  235  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.21 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  41.61 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  42.31 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  42.81 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  43.42 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  41.52 
 
 		 309 aa  232  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  41.5 
 
 		 320 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  46.69 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.13 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  41.18 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  41.58 
 
 		 301 aa  229  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  41.18 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  40.62 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.79 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.79 
 
 		 303 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  42.5 
 
 		 332 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.46 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.79 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  39.24 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.46 
 
 		 303 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  42.32 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  41.67 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.13 
 
 		 303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  41.67 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.79 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.79 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.79 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.79 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.34 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  38.91 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.01 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.73 
 
 		 326 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  41.3 
 
 		 328 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5035  pyruvate carboxyltransferase  43.81 
 
 		 311 aa  221  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.47 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  40.91 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.47 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.47 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.55 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  41.99 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  41.1 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  40.58 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.79 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  41.34 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  40.33 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.43 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  40.99 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2967  pyruvate carboxyltransferase  43 
 
 		 331 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0153  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.51 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  39.73 
 
 		 306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.72 
 
 		 319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.16 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  40.14 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  40.49 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  40 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  39.13 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.39 
 
 		 314 aa  212  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0607  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.11 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314247  normal  0.692973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.15 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.62 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  41.36 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  40.14 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.75 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  39.66 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  39.44 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  40.41 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  40.75 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1101  pyruvate carboxyltransferase  40.64 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  38.44 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0149  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.93 
 
 		 315 aa  208  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.26457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  38.51 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  37.83 
 
 		 311 aa  208  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  39.08 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.14 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4155  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.5 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.03 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.07 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4049  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.44 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0594588  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4710  pyruvate carboxyltransferase  37.38 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  36.7 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.1 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.1 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2773  pyruvate carboxyltransferase  40.53 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>