More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4125 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 
313 aa  626  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  72.22 
 
 
310 aa  431  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  53.16 
 
 
305 aa  288  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.64 
 
 
299 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  49.17 
 
 
304 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  48.81 
 
 
314 aa  275  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  51.33 
 
 
303 aa  275  8e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.33 
 
 
309 aa  272  7e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.86 
 
 
297 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  46.03 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  52 
 
 
303 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.67 
 
 
319 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  48.24 
 
 
313 aa  259  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.51 
 
 
303 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  42.81 
 
 
302 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44 
 
 
303 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  46.45 
 
 
320 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  47.78 
 
 
328 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.81 
 
 
303 aa  255  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0312  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.15 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  47.02 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0343  pyruvate carboxyltransferase  45.48 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  47.02 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  47.18 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  47.02 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  46.94 
 
 
315 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.67 
 
 
303 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.67 
 
 
303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  41.81 
 
 
302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.16 
 
 
299 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  45.18 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44 
 
 
303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5964  pyruvate carboxyltransferase  45 
 
 
313 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0367175  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.49 
 
 
299 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3038  pyruvate carboxyltransferase  43.62 
 
 
304 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.928882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  48.69 
 
 
309 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  44.37 
 
 
311 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.49 
 
 
299 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.67 
 
 
303 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.49 
 
 
299 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.03 
 
 
308 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.67 
 
 
303 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.67 
 
 
303 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.67 
 
 
303 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.33 
 
 
303 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3354  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.67 
 
 
307 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3757  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.29 
 
 
304 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0122709  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.67 
 
 
303 aa  250  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.23 
 
 
321 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.96 
 
 
299 aa  248  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.48 
 
 
299 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  45.36 
 
 
312 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  46.2 
 
 
308 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  44.41 
 
 
302 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.47 
 
 
299 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  48.15 
 
 
311 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.15 
 
 
314 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  48.48 
 
 
308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4710  pyruvate carboxyltransferase  43.52 
 
 
306 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  45.27 
 
 
318 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  44.85 
 
 
311 aa  245  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0477  pyruvate carboxyltransferase  43.19 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.14 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  45 
 
 
306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  45.18 
 
 
315 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  45.97 
 
 
317 aa  242  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.48 
 
 
299 aa  242  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.48 
 
 
336 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  45.24 
 
 
301 aa  241  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2063  pyruvate carboxyltransferase  43.67 
 
 
304 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0514  pyruvate carboxyltransferase  44.48 
 
 
303 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00792422  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  45.66 
 
 
320 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  43.14 
 
 
298 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2126  pyruvate carboxyltransferase  45 
 
 
299 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.129667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.3 
 
 
299 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  43.33 
 
 
306 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  45.34 
 
 
320 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.15 
 
 
326 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  42.28 
 
 
296 aa  238  9e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.72 
 
 
298 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  41.61 
 
 
296 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  43.73 
 
 
305 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1940  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.06 
 
 
304 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.307176  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4155  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.19 
 
 
306 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3278  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.9 
 
 
300 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  44.71 
 
 
315 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.67 
 
 
308 aa  236  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  43.29 
 
 
301 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  47.32 
 
 
309 aa  235  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  45.33 
 
 
315 aa  235  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  43.29 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49510  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.93 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00876047  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000381  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.61 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13643  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A lyase  41.37 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  46.1 
 
 
325 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.18 
 
 
313 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  44.3 
 
 
301 aa  233  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  45.95 
 
 
298 aa  232  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  41.14 
 
 
296 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.13 
 
 
301 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>