More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2302 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 311 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  98.37 
 
 		 308 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  99.03 
 
 		 314 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  82.3 
 
 		 315 aa  497  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  58.55 
 
 		 314 aa  353  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  56.23 
 
 		 297 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  53.36 
 
 		 299 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  54.3 
 
 		 301 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  51.9 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  51.56 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  50.33 
 
 		 307 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2850  pyruvate carboxyltransferase  50.66 
 
 		 307 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.15 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 307 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  54.67 
 
 		 298 aa  291  9e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.81 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.8 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.47 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  50.69 
 
 		 301 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.47 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.47 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0040  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.25 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.14 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.47 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.67 
 
 		 299 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  47.51 
 
 		 296 aa  288  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.14 
 
 		 303 aa  288  7e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.15 
 
 		 299 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.8 
 
 		 303 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.31 
 
 		 299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.26 
 
 		 299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.42 
 
 		 315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  47.49 
 
 		 296 aa  285  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2126  pyruvate carboxyltransferase  52.67 
 
 		 299 aa  285  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.129667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  52.49 
 
 		 315 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0014  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.25 
 
 		 287 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.42 
 
 		 315 aa  285  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00102  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.79 
 
 		 298 aa  285  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135051  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.32 
 
 		 295 aa  285  9e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.88 
 
 		 308 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  51.16 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49510  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.9 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00876047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.81 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.06 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2326  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.71 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43357 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1668  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.06 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.92 
 
 		 299 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.06 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  53.64 
 
 		 309 aa  281  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  49.67 
 
 		 298 aa  281  9e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.97 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1715  pyruvate carboxyltransferase  51.62 
 
 		 315 aa  280  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1940  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  55.94 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.307176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  48.93 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.81 
 
 		 301 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.72 
 
 		 299 aa  278  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3293  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.68 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.71 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0343  pyruvate carboxyltransferase  48.45 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.2 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  49.35 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.2 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.03 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0312  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.77 
 
 		 306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.56 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.56 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  45.21 
 
 		 302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.38 
 
 		 319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4270  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.75 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13643  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A lyase  48.11 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404031  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  44.88 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.07 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.73 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.73 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  48.21 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.73 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.16 
 
 		 310 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  51.18 
 
 		 309 aa  271  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.63 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4049  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.63 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0594588  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.1 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.77 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6309  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.83 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3278  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.76 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  51.85 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  47.32 
 
 		 302 aa  269  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.99 
 
 		 314 aa  269  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  48.48 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38490  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.08 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.04 
 
 		 303 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2780  pyruvate carboxyltransferase  47.81 
 
 		 301 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  0.241199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  48.23 
 
 		 306 aa  265  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  47.52 
 
 		 306 aa  264  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1462  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.32 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5964  pyruvate carboxyltransferase  45.75 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0367175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4049  pyruvate carboxyltransferase  53.21 
 
 		 360 aa  261  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal  0.299101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0739  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.24 
 
 		 288 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.5891  normal  0.963586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>