More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2358 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  100 
 
 		 303 aa  629  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  97.69 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  98.02 
 
 		 303 aa  618  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  98.02 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  97.69 
 
 		 303 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  97.36 
 
 		 303 aa  614  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  97.69 
 
 		 303 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  97.36 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  97.69 
 
 		 303 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  96.37 
 
 		 303 aa  607  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  91.42 
 
 		 303 aa  586  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  59.32 
 
 		 299 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  60 
 
 		 297 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  52.22 
 
 		 314 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  50.53 
 
 		 301 aa  310  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.88 
 
 		 308 aa  301  7.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  50.17 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.15 
 
 		 299 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.17 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  48.5 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.83 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.17 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.49 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.17 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49510  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.8 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00876047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.99 
 
 		 301 aa  288  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  48.81 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  47.3 
 
 		 296 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.16 
 
 		 298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  46.82 
 
 		 311 aa  285  9e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  47.78 
 
 		 301 aa  285  9e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  48.3 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  47.67 
 
 		 301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  47.44 
 
 		 296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  45.73 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  44.56 
 
 		 298 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2326  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.73 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  48.47 
 
 		 296 aa  279  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1668  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.73 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.1 
 
 		 299 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.8 
 
 		 314 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.44 
 
 		 299 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.82 
 
 		 299 aa  278  9e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1715  pyruvate carboxyltransferase  48.36 
 
 		 315 aa  277  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.36 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  45.95 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  45.95 
 
 		 302 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.36 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.82 
 
 		 299 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  47.8 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05477  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.49 
 
 		 298 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  47.8 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  44.63 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3293  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.3 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  44.71 
 
 		 306 aa  275  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  47.08 
 
 		 307 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  46.78 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0114  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.81 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2850  pyruvate carboxyltransferase  47.42 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0153  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.48 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3278  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.67 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0607  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.22 
 
 		 310 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314247  normal  0.692973 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  47.08 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  46.26 
 
 		 306 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  47.46 
 
 		 309 aa  272  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  47.08 
 
 		 307 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.1 
 
 		 314 aa  271  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  43 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  44.48 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.33 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  44.64 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0121  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.48 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38490  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.67 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  41.02 
 
 		 308 aa  269  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  44.26 
 
 		 327 aa  268  8.999999999999999e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2126  pyruvate carboxyltransferase  45.12 
 
 		 299 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.129667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4049  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.89 
 
 		 303 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0594588  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  44.56 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0477  pyruvate carboxyltransferase  43.46 
 
 		 308 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.6 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0040  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.81 
 
 		 287 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  43 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00102  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.56 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135051  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4536  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.74 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  43.2 
 
 		 313 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4155  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.14 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2536  pyruvate carboxyltransferase  45.36 
 
 		 306 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  43.34 
 
 		 304 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.47 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.47 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  42.86 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.47 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.21 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  42.71 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0261  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.81 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.39725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000381  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.92 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  44.03 
 
 		 303 aa  262  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2780  pyruvate carboxyltransferase  43.64 
 
 		 301 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  0.241199 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7692  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.64 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3354  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.37 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>