More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1472 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 321 aa  658    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  57.38 
 
 		 321 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  56.25 
 
 		 320 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  56.48 
 
 		 320 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  56.48 
 
 		 320 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  58.33 
 
 		 308 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  56.42 
 
 		 311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  54.72 
 
 		 318 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  56.25 
 
 		 320 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  55.41 
 
 		 308 aa  348  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  54.02 
 
 		 313 aa  346  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  52.92 
 
 		 309 aa  346  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  55.9 
 
 		 312 aa  346  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  54.24 
 
 		 306 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  56.25 
 
 		 320 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  54.58 
 
 		 308 aa  342  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  55.78 
 
 		 331 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.75 
 
 		 326 aa  342  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  53.55 
 
 		 315 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.9 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  55.45 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  56.31 
 
 		 327 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  56.62 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  50.31 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  49.51 
 
 		 324 aa  332  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  54 
 
 		 315 aa  329  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.32 
 
 		 327 aa  328  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.33 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  48.52 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.01 
 
 		 326 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.96 
 
 		 319 aa  293  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.68 
 
 		 309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  47.33 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  46.64 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  46.1 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  45.79 
 
 		 303 aa  271  9e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  45.36 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  45.64 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  46.03 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.08 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  44.03 
 
 		 317 aa  262  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.72 
 
 		 297 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  45.21 
 
 		 303 aa  258  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  46.78 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  43.79 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  41.64 
 
 		 314 aa  255  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  43.75 
 
 		 305 aa  252  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.3 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  40.85 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  41.52 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3757  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.82 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0122709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3038  pyruvate carboxyltransferase  40.82 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.928882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.96 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  41.03 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.3 
 
 		 303 aa  242  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.96 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  42.01 
 
 		 301 aa  242  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.96 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  39.53 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  40.97 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.61 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.96 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.3 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.96 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.96 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.96 
 
 		 303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.2 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  40.14 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0049  pyruvate carboxyltransferase  41.53 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  38.18 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1101  pyruvate carboxyltransferase  41 
 
 		 314 aa  236  4e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5964  pyruvate carboxyltransferase  39.26 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0367175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.91 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4155  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.27 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.54 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2063  pyruvate carboxyltransferase  40.2 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1588  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.8 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1612  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.8 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  40.89 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.81 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.59 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3494  pyruvate carboxyltransferase  39.67 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  38.57 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6309  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.44 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.07 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.89 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  39.8 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2317  pyruvate carboxyltransferase  42.52 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0819697 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.81 
 
 		 311 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.81 
 
 		 311 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.81 
 
 		 311 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0445  pyruvate carboxyltransferase  42.57 
 
 		 312 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.73 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.07 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  40.41 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2490  pyruvate carboxyltransferase  40.2 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.387658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.78 
 
 		 308 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.07 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4270  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.78 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.71 
 
 		 310 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>