More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0762 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 327 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  67.65 
 
 		 328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  66.99 
 
 		 313 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  66.56 
 
 		 315 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  50.69 
 
 		 318 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  47.97 
 
 		 305 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.41 
 
 		 299 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  49.66 
 
 		 324 aa  295  9e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  47.47 
 
 		 311 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  50.69 
 
 		 312 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  49.31 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.64 
 
 		 313 aa  291  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 315 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  50.69 
 
 		 308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  48.3 
 
 		 303 aa  288  9e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.49 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  50.87 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.14 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.42 
 
 		 336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.31 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  46.64 
 
 		 321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  46.8 
 
 		 304 aa  281  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.07 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.02 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.63 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.41 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  45.86 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.07 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.49 
 
 		 303 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.07 
 
 		 303 aa  275  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  45.73 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.75 
 
 		 303 aa  275  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.41 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.07 
 
 		 303 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  47.57 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.07 
 
 		 303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.07 
 
 		 303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.07 
 
 		 303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  48.99 
 
 		 317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.73 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  45.05 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  45.86 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  45.05 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  44.41 
 
 		 314 aa  268  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  44.37 
 
 		 309 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.49 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  45.86 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  46.15 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  44.78 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  46.21 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  44.67 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  45.12 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  44.83 
 
 		 301 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.71 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.61 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.61 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.61 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.26 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  45.58 
 
 		 296 aa  258  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  44.86 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  44.6 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  47.02 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  44.25 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.69 
 
 		 299 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  44.14 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  44.14 
 
 		 311 aa  255  8e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.37 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  45.39 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0153  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.42 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  43.84 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  42.61 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4270  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.07 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.33 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  44.59 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.3 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0607  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.72 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314247  normal  0.692973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.75 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.86 
 
 		 310 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.51 
 
 		 310 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.37 
 
 		 308 aa  248  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.51 
 
 		 310 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.51 
 
 		 310 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  41.92 
 
 		 302 aa  248  9e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  43.64 
 
 		 296 aa  248  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.51 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  44.13 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6309  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.16 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.37 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.32 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.16 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000381  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.15 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.62 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.11 
 
 		 299 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  42.21 
 
 		 294 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  43.17 
 
 		 307 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2326  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3354  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.56 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.75 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>