More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2729 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  100 
 
 		 336 aa  693    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  74.38 
 
 		 326 aa  482  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  69.38 
 
 		 329 aa  471  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  69.51 
 
 		 332 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  67.81 
 
 		 324 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  67.49 
 
 		 327 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  66.34 
 
 		 321 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  65.89 
 
 		 320 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  65.56 
 
 		 320 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  65.56 
 
 		 320 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  65.56 
 
 		 320 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  62.07 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  60.9 
 
 		 315 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  61.29 
 
 		 313 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  60.84 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  65.56 
 
 		 320 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  61.76 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  62.54 
 
 		 325 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  57.93 
 
 		 309 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  55.96 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  55.19 
 
 		 318 aa  352  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  54.33 
 
 		 308 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  55.05 
 
 		 312 aa  345  8.999999999999999e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  56.77 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  52.9 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  54.52 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  55.19 
 
 		 326 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  55.15 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  56 
 
 		 306 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  53.44 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  47.42 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  48.8 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  48.16 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  49.14 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.82 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  44.52 
 
 		 317 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  46.33 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49 
 
 		 309 aa  262  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  47.28 
 
 		 304 aa  262  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.92 
 
 		 319 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.86 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  44.63 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  47.1 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  47.49 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.97 
 
 		 303 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.62 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.62 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.97 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.97 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.97 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.97 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.62 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.62 
 
 		 303 aa  241  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.62 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  45.48 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.62 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  43.64 
 
 		 296 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  42.55 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  46.42 
 
 		 301 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  45.3 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  41.24 
 
 		 306 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  38.91 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  38.7 
 
 		 302 aa  225  7e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  43.84 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  38.57 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  38.57 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2850  pyruvate carboxyltransferase  38.57 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  39.86 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  39.52 
 
 		 296 aa  222  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2326  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.01 
 
 		 315 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.01 
 
 		 315 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  38.49 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  38.91 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1668  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.01 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.14 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.79 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.64 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1715  pyruvate carboxyltransferase  42.05 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  37.67 
 
 		 302 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.8 
 
 		 310 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.46 
 
 		 310 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  40.96 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2317  pyruvate carboxyltransferase  43.46 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0819697 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6309  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.46 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.12 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.12 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.12 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  39.04 
 
 		 301 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  40.43 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.01 
 
 		 299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.01 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5035  pyruvate carboxyltransferase  41.98 
 
 		 311 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1303  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.42 
 
 		 287 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.15453  normal  0.0935443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  40.21 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.51 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.85 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.85 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.85 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0445  pyruvate carboxyltransferase  45.13 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3354  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.32 
 
 		 307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>