More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3515 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  53.22 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.45 
 
 		 299 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.17 
 
 		 297 aa  258  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  44.86 
 
 		 304 aa  254  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  44.86 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.84 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.18 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.5 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.14 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.84 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.84 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.5 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.84 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.84 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.84 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.16 
 
 		 303 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  44.44 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  45.42 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  42.57 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.48 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  45.39 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  45.1 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  43.49 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  43.49 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  45.21 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  44.37 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.06 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2850  pyruvate carboxyltransferase  43.55 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.49 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  43.55 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  43.73 
 
 		 328 aa  236  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  43.88 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  43.6 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  45.8 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  43.6 
 
 		 307 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  44.06 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  44.76 
 
 		 306 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  43.36 
 
 		 302 aa  234  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4155  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.1 
 
 		 306 aa  234  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  41.89 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  42.91 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5035  pyruvate carboxyltransferase  46.62 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3757  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.71 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0122709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3038  pyruvate carboxyltransferase  42.71 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.928882  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  45.8 
 
 		 315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.06 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  46.47 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0477  pyruvate carboxyltransferase  43.49 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  43.4 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.96 
 
 		 295 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.66 
 
 		 303 aa  231  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.36 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.1 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.36 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.36 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.36 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  42.52 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4270  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.1 
 
 		 309 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  39.8 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  42.81 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5964  pyruvate carboxyltransferase  42.41 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0367175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  42.57 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.97 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  42.37 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  40.85 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.82 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  42.76 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  38.44 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000381  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.26 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0514  pyruvate carboxyltransferase  41.96 
 
 		 303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00792422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.71 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  44.56 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0348  pyruvate carboxyltransferase  44.22 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  45.02 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  38.1 
 
 		 302 aa  225  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4710  pyruvate carboxyltransferase  42.27 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.77 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  43.3 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.97 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  43.88 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  42.27 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.88 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1558  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.84 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.953041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  42.42 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  41.2 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.2 
 
 		 299 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.86 
 
 		 299 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  40.89 
 
 		 317 aa  222  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.86 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1940  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.81 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.307176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.91 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2326  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.7 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.7 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1668  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.7 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.2 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3293  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.75 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.97 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.79 
 
 		 298 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.68 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>