More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0348 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0348  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 315 aa  628  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  72.48 
 
 		 309 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  67.66 
 
 		 315 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  69.73 
 
 		 298 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  65.8 
 
 		 314 aa  401  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21580  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  64.05 
 
 		 319 aa  399  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  65.69 
 
 		 309 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0149  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  66 
 
 		 315 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.26457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4049  pyruvate carboxyltransferase  70.03 
 
 		 360 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal  0.299101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  54.3 
 
 		 298 aa  316  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  52.38 
 
 		 306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  50.84 
 
 		 311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 301 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50 
 
 		 310 aa  298  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0153  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.17 
 
 		 311 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.46 
 
 		 299 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.15 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.15 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.15 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3293  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.2 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  49.49 
 
 		 301 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0114  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.83 
 
 		 309 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  47.68 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0121  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  49.33 
 
 		 301 aa  290  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50 
 
 		 299 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.49 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0607  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.81 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314247  normal  0.692973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1462  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.17 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49510  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.83 
 
 		 300 aa  285  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00876047  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  45.79 
 
 		 302 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  47.46 
 
 		 296 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.97 
 
 		 299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.49 
 
 		 301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2126  pyruvate carboxyltransferase  47.65 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.129667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.97 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.28 
 
 		 297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.3 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.64 
 
 		 299 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.99 
 
 		 299 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.16 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  48.14 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.16 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.62 
 
 		 299 aa  281  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6309  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.14 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.83 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  46.62 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  45.45 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.44 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.83 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000381  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.8 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.8 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.07 
 
 		 299 aa  278  7e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4270  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.83 
 
 		 309 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.16 
 
 		 310 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.16 
 
 		 310 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  46.62 
 
 		 296 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.51 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.56 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3278  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.97 
 
 		 300 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.73 
 
 		 299 aa  275  7e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00102  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.55 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4049  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.16 
 
 		 303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0594588  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2536  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 306 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38490  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.62 
 
 		 300 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5964  pyruvate carboxyltransferase  45.82 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0367175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2932  pyruvate carboxyltransferase  48.31 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0477  pyruvate carboxyltransferase  47.49 
 
 		 308 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  48.47 
 
 		 306 aa  269  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4710  pyruvate carboxyltransferase  45.57 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2810  pyruvate carboxyltransferase  48.31 
 
 		 301 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.631686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  45.36 
 
 		 307 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  45.36 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  45.36 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.73 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2780  pyruvate carboxyltransferase  49.49 
 
 		 301 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  0.241199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3757  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.13 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0122709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3038  pyruvate carboxyltransferase  46.13 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.928882  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  46.96 
 
 		 302 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1940  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50 
 
 		 304 aa  265  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.307176  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0261  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.46 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.39725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13643  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A lyase  46.56 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404031  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2850  pyruvate carboxyltransferase  44.33 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4155  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.15 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2063  pyruvate carboxyltransferase  44.97 
 
 		 304 aa  262  6e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.42 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3354  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.83 
 
 		 307 aa  259  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.73 
 
 		 303 aa  258  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  43.26 
 
 		 301 aa  258  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.73 
 
 		 303 aa  258  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.07 
 
 		 303 aa  258  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0514  pyruvate carboxyltransferase  46.32 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00792422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.14 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.39 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2326  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.33 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43357 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0343  pyruvate carboxyltransferase  47.47 
 
 		 306 aa  256  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.99 
 
 		 315 aa  255  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.05 
 
 		 303 aa  255  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>