More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6617 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  100 
 
 		 319 aa  623  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  62.46 
 
 		 296 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2863  pyruvate carboxyltransferase  61.92 
 
 		 300 aa  335  5e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  59.52 
 
 		 307 aa  322  7e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0961  pyruvate carboxyltransferase  53.64 
 
 		 305 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2390  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.33 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369833 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3976  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0304522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.49 
 
 		 304 aa  268  8e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  50.53 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  51.86 
 
 		 301 aa  265  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1697  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.54 
 
 		 297 aa  265  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00979317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.97 
 
 		 314 aa  255  8e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  46.85 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1146  pyruvate carboxyltransferase  48.34 
 
 		 311 aa  252  6e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.1 
 
 		 297 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.68 
 
 		 299 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  47.24 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  47.93 
 
 		 303 aa  249  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  48.28 
 
 		 301 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  49.12 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  48.51 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  45.45 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  45.95 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  45.94 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  46.37 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.21 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0121  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.98 
 
 		 309 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0114  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.98 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2126  pyruvate carboxyltransferase  45.52 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.129667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  44.56 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.89 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0153  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.71 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.89 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.89 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  48.12 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  43.77 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0607  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.37 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314247  normal  0.692973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.1 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  45.05 
 
 		 311 aa  235  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  44.72 
 
 		 296 aa  235  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  43.69 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  43.77 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.42 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0049  pyruvate carboxyltransferase  45.42 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.45 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.72 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.42 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.42 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.42 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0348  pyruvate carboxyltransferase  45.17 
 
 		 315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  40.89 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.07 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.42 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.07 
 
 		 303 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.07 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.07 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.74 
 
 		 310 aa  231  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  42.91 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.46 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.72 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0149  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.39 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.26457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49510  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.06 
 
 		 300 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00876047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.64 
 
 		 299 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.2 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2780  pyruvate carboxyltransferase  44.29 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  0.241199 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.39 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.05 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  45.39 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3293  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.24 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.37 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4049  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.16 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0594588  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6309  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.05 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  41.81 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.73 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.73 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.61 
 
 		 301 aa  228  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13643  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A lyase  42.96 
 
 		 321 aa  228  8e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0261  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.02 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.39725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.82 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.91 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.67 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.7 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3092  pyruvate carboxyltransferase  42.36 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  0.0987671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.52 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  43.64 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.21 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.12 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0514  pyruvate carboxyltransferase  43.66 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00792422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2810  pyruvate carboxyltransferase  44.68 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.631686  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.85 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3354  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.19 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2536  pyruvate carboxyltransferase  43.51 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2063  pyruvate carboxyltransferase  43.97 
 
 		 304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  43.77 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  42.42 
 
 		 318 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  42.56 
 
 		 302 aa  226  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  39.64 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  41.96 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4155  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.67 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.951896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>