More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2863 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2863  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 300 aa  595  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  62.03 
 
 		 296 aa  352  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  63.27 
 
 		 307 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  61.92 
 
 		 319 aa  330  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0961  pyruvate carboxyltransferase  53.38 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3976  pyruvate carboxyltransferase  52.38 
 
 		 317 aa  288  7e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0304522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.17 
 
 		 304 aa  282  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1697  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  54.61 
 
 		 297 aa  281  9e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00979317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  52.35 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2390  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.15 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369833 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1146  pyruvate carboxyltransferase  46.96 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  38.23 
 
 		 294 aa  228  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.3 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.3 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.3 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  43 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  43.84 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3092  pyruvate carboxyltransferase  41.88 
 
 		 317 aa  224  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  0.0987671 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.96 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.94 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3354  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.81 
 
 		 307 aa  221  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  42.96 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3494  pyruvate carboxyltransferase  41.23 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0049  pyruvate carboxyltransferase  43.84 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6309  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.81 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  42.35 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.81 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.53 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  43.45 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0121  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.69 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  40.96 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  41.5 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.61 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.61 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  42.47 
 
 		 328 aa  215  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  43.55 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.47 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.99 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0114  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.34 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.12 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.55 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  40.21 
 
 		 332 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3293  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.48 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2126  pyruvate carboxyltransferase  40.21 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.129667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.64 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  39.38 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.12 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.58 
 
 		 299 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.88 
 
 		 308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0607  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.76 
 
 		 310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314247  normal  0.692973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  41.67 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  37.33 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.89 
 
 		 299 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.28 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0153  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.72 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0348  pyruvate carboxyltransferase  41.5 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  39.18 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  41.78 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.96 
 
 		 314 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38490  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.07 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.41 
 
 		 303 aa  209  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.28 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  41.58 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1462  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.92 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  40.07 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  43.36 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0261  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.41 
 
 		 309 aa  208  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.39725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  39.66 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  39.46 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  38.78 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  40.8 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.18 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.36 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  40.07 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  39.73 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.36 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  41.81 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  38.18 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.54 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3278  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.06 
 
 		 300 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.36 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  40.7 
 
 		 311 aa  205  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.36 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49510  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.28 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00876047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.36 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.59 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  38.51 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  39.31 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5964  pyruvate carboxyltransferase  38.85 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0367175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2773  pyruvate carboxyltransferase  41.78 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  39.04 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  41.34 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.66 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3038  pyruvate carboxyltransferase  39.46 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.928882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.98 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.36 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  36.56 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2536  pyruvate carboxyltransferase  40.34 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7692  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.07 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>