More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0961 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0961  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  57.63 
 
 		 296 aa  322  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2863  pyruvate carboxyltransferase  53.38 
 
 		 300 aa  298  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  53.64 
 
 		 319 aa  278  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  52.88 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  49.5 
 
 		 301 aa  251  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1146  pyruvate carboxyltransferase  47.52 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.67 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2390  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.18 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1697  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.68 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00979317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.92 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  44.67 
 
 		 309 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.75 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.47 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3976  pyruvate carboxyltransferase  46.46 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0304522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  43.3 
 
 		 298 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  44.82 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  44.37 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0348  pyruvate carboxyltransferase  43 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.18 
 
 		 319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  42.36 
 
 		 301 aa  215  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  43.39 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  42.66 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  41.44 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  42.66 
 
 		 315 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.21 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  42.23 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.02 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  46.53 
 
 		 303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  44.14 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2773  pyruvate carboxyltransferase  44.1 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  42.01 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  43.58 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0049  pyruvate carboxyltransferase  41.98 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  44.11 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.75 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5035  pyruvate carboxyltransferase  45.97 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.71 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.71 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.71 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.99 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.33 
 
 		 303 aa  205  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.33 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  41.22 
 
 		 327 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.33 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.33 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  41.89 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3092  pyruvate carboxyltransferase  40.4 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  0.0987671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  41.67 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  36.33 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  41.78 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.61 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.99 
 
 		 303 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.99 
 
 		 303 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.99 
 
 		 303 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  41.38 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.64 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3494  pyruvate carboxyltransferase  40.07 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  41.7 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0149  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.86 
 
 		 315 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.26457  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  37.11 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.71 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  41.58 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.99 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.02 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.84 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  40.41 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  40.41 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.71 
 
 		 310 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4049  pyruvate carboxyltransferase  42.47 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal  0.299101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  41.86 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  40.41 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  42.12 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  40.07 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.36 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  41.1 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  42.41 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  39.73 
 
 		 331 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.34 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  36.08 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.48 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.75 
 
 		 308 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  42.52 
 
 		 301 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  39.19 
 
 		 305 aa  195  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.62 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  41.03 
 
 		 318 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  40.75 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  39.59 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  41.34 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  41.28 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  39.73 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  39.22 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  38.36 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.62 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0121  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.45 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.24 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.62 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.32 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13643  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A lyase  37.67 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.32 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>