More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3976 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3976  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 317 aa  632  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0304522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1697  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  57.19 
 
 		 297 aa  299  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00979317  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  52.9 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2863  pyruvate carboxyltransferase  52.38 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  51.88 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3092  pyruvate carboxyltransferase  47.47 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  0.0987671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3494  pyruvate carboxyltransferase  46.52 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0049  pyruvate carboxyltransferase  47.77 
 
 		 304 aa  255  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2390  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.31 
 
 		 303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  45.39 
 
 		 305 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  49.3 
 
 		 308 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  41.87 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  48.14 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.81 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  43.88 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.45 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  46.94 
 
 		 303 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  47.57 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.15 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  46.18 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  44.33 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  46.08 
 
 		 328 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.44 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  43.1 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0961  pyruvate carboxyltransferase  46.46 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  40.94 
 
 		 321 aa  225  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  41.03 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.17 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  43 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  44.44 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  47.47 
 
 		 303 aa  222  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.36 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.7 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.01 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  40.34 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.36 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.36 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.36 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  40.41 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.36 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.36 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.01 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.64 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  42.07 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  44.76 
 
 		 312 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2536  pyruvate carboxyltransferase  44.33 
 
 		 306 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.67 
 
 		 303 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.62 
 
 		 308 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2780  pyruvate carboxyltransferase  43.54 
 
 		 301 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  0.241199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.72 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.33 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  43.71 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2932  pyruvate carboxyltransferase  44.68 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.63 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  41.03 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0348  pyruvate carboxyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  215  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5035  pyruvate carboxyltransferase  46.2 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.2 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  39.8 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.13 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  40 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  40 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2810  pyruvate carboxyltransferase  43.62 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.631686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.62 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1146  pyruvate carboxyltransferase  41.36 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  42.55 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.84 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.26 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  39.38 
 
 		 306 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  40.94 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3757  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.4 
 
 		 304 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0122709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  41.75 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  39.11 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.14 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2126  pyruvate carboxyltransferase  40.07 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.129667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3038  pyruvate carboxyltransferase  42.81 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.928882  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  44.14 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  38.75 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4049  pyruvate carboxyltransferase  44.56 
 
 		 360 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal  0.299101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  44.41 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  42.32 
 
 		 309 aa  208  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.86 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.12 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.61 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  42.62 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.12 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  42.71 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  43.71 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  40 
 
 		 320 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0121  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.43 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  41.78 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  39.66 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.4 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.07 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2773  pyruvate carboxyltransferase  43.49 
 
 		 313 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49510  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.44 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00876047  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  40 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  39.04 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.93 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>