More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0177 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  100 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  51.02 
 
 		 296 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2863  pyruvate carboxyltransferase  50.17 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  52 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2390  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.54 
 
 		 303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  47.47 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1146  pyruvate carboxyltransferase  47.8 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.49 
 
 		 319 aa  255  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0961  pyruvate carboxyltransferase  46.67 
 
 		 305 aa  249  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  44.75 
 
 		 294 aa  248  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1697  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.5 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00979317  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  46.85 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  44.56 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  45.58 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  42.66 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3976  pyruvate carboxyltransferase  46.15 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0304522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  44.06 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.89 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  46.5 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  43.52 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  41.16 
 
 		 314 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  41.72 
 
 		 304 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  43.05 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  45.8 
 
 		 308 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  42.61 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  43.79 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  46.85 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.86 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.51 
 
 		 303 aa  222  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.86 
 
 		 303 aa  221  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.86 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  43.52 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.51 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.85 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  42.47 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3092  pyruvate carboxyltransferase  40.86 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  0.0987671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  41.55 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  43.52 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.64 
 
 		 336 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3494  pyruvate carboxyltransferase  40.53 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.67 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  42.21 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3354  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.76 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.29 
 
 		 729 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  40.14 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2536  pyruvate carboxyltransferase  43.16 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.5 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0049  pyruvate carboxyltransferase  40.6 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  40.48 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4049  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.7 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0594588  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  42.23 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  41.38 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  39.66 
 
 		 305 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.82 
 
 		 313 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2126  pyruvate carboxyltransferase  40.61 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.129667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.5 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3685  pyruvate carboxyltransferase  44.55 
 
 		 744 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  41.67 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.4 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.09 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.89 
 
 		 308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.16 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.54 
 
 		 298 aa  212  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2810  pyruvate carboxyltransferase  42.11 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.631686  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2773  pyruvate carboxyltransferase  43.15 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2780  pyruvate carboxyltransferase  40.48 
 
 		 301 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  0.241199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  38.7 
 
 		 301 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  34.93 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  37.67 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  41.02 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.92 
 
 		 319 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  35.81 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  38.93 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.48 
 
 		 299 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.36 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3293  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.84 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2932  pyruvate carboxyltransferase  41.4 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  40.14 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05273  3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A lyase/3-methylglutaconyl-coenzyme A hydratase (EC 4.1.3.4)(EC 4.2.1.18) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6S014]  40 
 
 		 599 aa  207  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.347874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0455  pyruvate carboxyltransferase  43.2 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  39.8 
 
 		 296 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4807  pyruvate carboxyltransferase  43.59 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5465  pyruvate carboxyltransferase  41.81 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0487859  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3038  pyruvate carboxyltransferase  40.89 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.928882  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  42.55 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  42.18 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5396  pyruvate carboxyltransferase  41.81 
 
 		 328 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615332  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  40.07 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.78 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.83 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3757  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.55 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0122709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0149  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.36 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.26457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>