More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5092 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 306 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  90.03 
 
 		 308 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  77.63 
 
 		 308 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  68.77 
 
 		 318 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  68.98 
 
 		 312 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  65.79 
 
 		 311 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  66.56 
 
 		 308 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  69.77 
 
 		 315 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  59.67 
 
 		 321 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  60.07 
 
 		 320 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  60.07 
 
 		 320 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  59.73 
 
 		 320 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  56.19 
 
 		 309 aa  355  6.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  56.44 
 
 		 313 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  58 
 
 		 320 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  54.24 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  56.86 
 
 		 315 aa  340  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  58.33 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  58.33 
 
 		 331 aa  339  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  59.93 
 
 		 326 aa  338  7e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  59.14 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  57.24 
 
 		 324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  59.6 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  56 
 
 		 336 aa  329  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  57 
 
 		 327 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  54.67 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  52.17 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  53.36 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.86 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  50.87 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  50.69 
 
 		 315 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.43 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.33 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  48.98 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.2 
 
 		 319 aa  272  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  50.16 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  50.87 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  47.4 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  48.96 
 
 		 303 aa  258  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  45.76 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  49 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.42 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.27 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  45.64 
 
 		 294 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.27 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.67 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.27 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.01 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.27 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.32 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.27 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  47.96 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.97 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  46.82 
 
 		 301 aa  245  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.58 
 
 		 303 aa  245  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  45 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.97 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  47.12 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3976  pyruvate carboxyltransferase  47.57 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0304522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.85 
 
 		 729 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  44.76 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2967  pyruvate carboxyltransferase  47.51 
 
 		 331 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0036  pyruvate carboxyltransferase  45.64 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.700183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  44.33 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.58 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2490  pyruvate carboxyltransferase  46.42 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.387658  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0445  pyruvate carboxyltransferase  47.7 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  42.81 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  45.7 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0049  pyruvate carboxyltransferase  45.7 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  44.52 
 
 		 315 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3143  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.42 
 
 		 323 aa  232  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.37 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.48 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.48 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.48 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4270  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.14 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  42.46 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.37 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.02 
 
 		 308 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.45 
 
 		 308 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.03 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2773  pyruvate carboxyltransferase  46.89 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.91 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.71 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  38.1 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6309  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.78 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.87 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.87 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2980  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.78 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3092  pyruvate carboxyltransferase  42.38 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  0.0987671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3685  pyruvate carboxyltransferase  47.18 
 
 		 744 aa  225  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1303  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.6 
 
 		 287 aa  225  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.15453  normal  0.0935443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1922  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.08 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0455  pyruvate carboxyltransferase  45.97 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3494  pyruvate carboxyltransferase  42.05 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  43.75 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  45.12 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1612  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.79 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>