More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2107 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  100 
 
 		 326 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  80.5 
 
 		 326 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  60.53 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  60.53 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  61.79 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  61.33 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  59.67 
 
 		 315 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  59.54 
 
 		 320 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  61.13 
 
 		 324 aa  361  8e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  61.67 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  58.22 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  59.93 
 
 		 320 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  60.2 
 
 		 327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  57.88 
 
 		 313 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  59.93 
 
 		 320 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  54.25 
 
 		 309 aa  345  7e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  60.13 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  56.77 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  55.19 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  55.78 
 
 		 331 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  51.8 
 
 		 318 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  50.33 
 
 		 321 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  51 
 
 		 311 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  54.72 
 
 		 332 aa  317  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.33 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  50.17 
 
 		 312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  52.53 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  52.67 
 
 		 315 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  51.83 
 
 		 308 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  52.86 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.84 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  46.8 
 
 		 305 aa  269  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  47.14 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.34 
 
 		 299 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.05 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  47.81 
 
 		 303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  44.76 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  47.6 
 
 		 314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  41.3 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  44.41 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  42.66 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.37 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.37 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.37 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.03 
 
 		 303 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.03 
 
 		 303 aa  245  9e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.03 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.03 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.03 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.03 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.03 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  42.18 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.69 
 
 		 303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  43.42 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  44.15 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3092  pyruvate carboxyltransferase  42.86 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  0.0987671 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  40.48 
 
 		 294 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  46.35 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  43.84 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3494  pyruvate carboxyltransferase  42.19 
 
 		 317 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  40.75 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0445  pyruvate carboxyltransferase  47.04 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  40.75 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  40.82 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.67 
 
 		 303 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2126  pyruvate carboxyltransferase  40.27 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.129667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0049  pyruvate carboxyltransferase  41.69 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3757  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.99 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0122709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  42.81 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  39.73 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  42.67 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  45.1 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  39.73 
 
 		 311 aa  222  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3038  pyruvate carboxyltransferase  40.64 
 
 		 304 aa  222  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.928882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  39.04 
 
 		 301 aa  222  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.31 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.7 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2773  pyruvate carboxyltransferase  43.01 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2326  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.31 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.45 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  39.87 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  41.11 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4804  pyruvate carboxyltransferase  44.28 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4807  pyruvate carboxyltransferase  44.28 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1668  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.31 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  38.31 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  43.39 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  38.7 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3976  pyruvate carboxyltransferase  41.64 
 
 		 317 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0304522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5348  pyruvate carboxyltransferase  43.54 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1715  pyruvate carboxyltransferase  39.65 
 
 		 315 aa  219  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0514  pyruvate carboxyltransferase  39.58 
 
 		 303 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00792422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  41.44 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.63 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2850  pyruvate carboxyltransferase  37.97 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  42.18 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  37.97 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>