More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5035 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5035  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 311 aa  608  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4266  pyruvate carboxyltransferase  62.46 
 
 		 317 aa  351  8.999999999999999e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0273285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1558  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  60.61 
 
 		 301 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.953041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1894  pyruvate carboxyltransferase  60.34 
 
 		 301 aa  335  7e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1588  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  59.6 
 
 		 301 aa  331  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1612  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  59.6 
 
 		 301 aa  331  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4466  pyruvate carboxyltransferase  60 
 
 		 301 aa  321  9.000000000000001e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  52.36 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  56.23 
 
 		 309 aa  308  5e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  50.68 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  50.68 
 
 		 303 aa  288  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  51.69 
 
 		 303 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  48.63 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.26 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  46.62 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.76 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  47.59 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  45.12 
 
 		 314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.11 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  39.53 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  43.05 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  43.81 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3976  pyruvate carboxyltransferase  46.2 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0304522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.97 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  42.91 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.18 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  42.91 
 
 		 312 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.61 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.98 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  44.44 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  44.26 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  43.69 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  43.94 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  45.52 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  40.14 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  44.22 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  41.86 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0961  pyruvate carboxyltransferase  45.97 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.37 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.63 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.97 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  44.52 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.29 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  40.2 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  45.36 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.29 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  41.33 
 
 		 311 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  44.37 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.55 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.29 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.63 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  44.37 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05477  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.93 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.29 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.29 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.29 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.55 
 
 		 319 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.29 
 
 		 303 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3092  pyruvate carboxyltransferase  41.2 
 
 		 317 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  0.0987671 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  41.22 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  41.22 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  40.41 
 
 		 329 aa  215  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  42.07 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2390  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.14 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  42.76 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2773  pyruvate carboxyltransferase  43.51 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  40.67 
 
 		 320 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  39.86 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  43.88 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.67 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  40.89 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.02 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  39.6 
 
 		 327 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  40.78 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.86 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0806  pyruvate carboxyltransferase  44.07 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  41.49 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  41.38 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  42.95 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3494  pyruvate carboxyltransferase  39.53 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0348  pyruvate carboxyltransferase  41.84 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  43.42 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  42.67 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.33 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.38 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  38.51 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000381  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.72 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.76 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2490  pyruvate carboxyltransferase  43.05 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.387658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  42.76 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  42.14 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3143  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.05 
 
 		 323 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2932  pyruvate carboxyltransferase  42.55 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  38.95 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.66 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0036  pyruvate carboxyltransferase  43.81 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.700183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2810  pyruvate carboxyltransferase  41.84 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.631686  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2559  pyruvate carboxyltransferase  40.68 
 
 		 302 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.09 
 
 		 327 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0402015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2536  pyruvate carboxyltransferase  41.49 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>