More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0806 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0806  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 325 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3394  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase, putative  63.84 
 
 		 309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.461441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2559  pyruvate carboxyltransferase  63.58 
 
 		 302 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0455  pyruvate carboxyltransferase  56.68 
 
 		 313 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3685  pyruvate carboxyltransferase  57.38 
 
 		 744 aa  332  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  56.62 
 
 		 729 aa  328  8e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4807  pyruvate carboxyltransferase  54.43 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5348  pyruvate carboxyltransferase  54.19 
 
 		 333 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5465  pyruvate carboxyltransferase  53.67 
 
 		 328 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0487859  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4804  pyruvate carboxyltransferase  53.8 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5396  pyruvate carboxyltransferase  53.48 
 
 		 328 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2490  pyruvate carboxyltransferase  54.28 
 
 		 323 aa  316  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.387658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2967  pyruvate carboxyltransferase  53.85 
 
 		 331 aa  315  9e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3143  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  53.95 
 
 		 323 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0445  pyruvate carboxyltransferase  55.63 
 
 		 312 aa  309  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2061  pyruvate carboxyltransferase  50.79 
 
 		 326 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.32 
 
 		 327 aa  305  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0402015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0036  pyruvate carboxyltransferase  53.33 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.700183 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6613  pyruvate carboxyltransferase  49.84 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5984  pyruvate carboxyltransferase  51.28 
 
 		 313 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6280  pyruvate carboxyltransferase  51.6 
 
 		 313 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1756  pyruvate carboxyltransferase  52.48 
 
 		 315 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1123  pyruvate carboxyltransferase  50.16 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0217211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6961  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.33 
 
 		 313 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3137  pyruvate carboxyltransferase  50.16 
 
 		 317 aa  288  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676555  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2762  pyruvate carboxyltransferase  49.83 
 
 		 329 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6248  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.84 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938402  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2695  pyruvate carboxyltransferase  48.54 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0438  pyruvate carboxyltransferase  52.29 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.99 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  43.04 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  43.42 
 
 		 304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  44.78 
 
 		 305 aa  222  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.24 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  45.07 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.44 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  46.84 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  40.26 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  42.96 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  42.11 
 
 		 317 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4194  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.22 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.2 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  44.37 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  43.88 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  42.81 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.77 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2317  pyruvate carboxyltransferase  46.71 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0819697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  41.77 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.38 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.3 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  43.52 
 
 		 327 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5035  pyruvate carboxyltransferase  44.07 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  39.07 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  40.85 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  39.06 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  41.78 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  41.1 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  41.78 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  41.78 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  40.33 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  39.06 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  42.14 
 
 		 308 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.33 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.46 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  43 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.64 
 
 		 314 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  44.15 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  41.64 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  40.33 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  42.75 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  43.12 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  40.91 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  38.76 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  40.6 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.09 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2776  pyruvate carboxyltransferase  42.61 
 
 		 313 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1922  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.75 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.46 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  41.28 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  42.2 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  38.29 
 
 		 329 aa  195  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13643  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A lyase  37.92 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.404031  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  41.33 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.24 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.4 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.75 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.27 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.04 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  40.71 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0312  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.71 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  38.94 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.04 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  39.46 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  40.98 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  40.93 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0343  pyruvate carboxyltransferase  38.71 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  38.46 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.76 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  38.46 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  40.82 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>