More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1922 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1922  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  100 
 
 		 308 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2776  pyruvate carboxyltransferase  86.42 
 
 		 313 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2317  pyruvate carboxyltransferase  63.16 
 
 		 307 aa  349  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0819697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2967  pyruvate carboxyltransferase  47.9 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  46.08 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.71 
 
 		 729 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  42.18 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  46.94 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0455  pyruvate carboxyltransferase  45.33 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3685  pyruvate carboxyltransferase  46.37 
 
 		 744 aa  215  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  43.92 
 
 		 308 aa  215  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  43.64 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0036  pyruvate carboxyltransferase  46.01 
 
 		 312 aa  212  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.700183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0445  pyruvate carboxyltransferase  47.55 
 
 		 312 aa  211  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2490  pyruvate carboxyltransferase  44.59 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.387658  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.03 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3143  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.44 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4804  pyruvate carboxyltransferase  44.97 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5348  pyruvate carboxyltransferase  44.75 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4807  pyruvate carboxyltransferase  44.63 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5396  pyruvate carboxyltransferase  44.63 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615332  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.53 
 
 		 327 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0402015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  40.98 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6961  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.59 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2762  pyruvate carboxyltransferase  43.27 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  43.42 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5465  pyruvate carboxyltransferase  44.3 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0487859  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  42.51 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2061  pyruvate carboxyltransferase  45.23 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.01 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  43.12 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  44.29 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.37 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6248  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.02 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  40.96 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5984  pyruvate carboxyltransferase  44.07 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2932  pyruvate carboxyltransferase  42.91 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6280  pyruvate carboxyltransferase  44.41 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  43.34 
 
 		 315 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.96 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  40.48 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  42.27 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.8 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.01 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.8 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.8 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2810  pyruvate carboxyltransferase  43.24 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.631686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3137  pyruvate carboxyltransferase  42.91 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676555  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2559  pyruvate carboxyltransferase  42.49 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1756  pyruvate carboxyltransferase  44.69 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.67 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  42.35 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  40 
 
 		 294 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  42.35 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  42.7 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  41.88 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.66 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  44.57 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.88 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.65 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  42.26 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  43.73 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  45.82 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.12 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2536  pyruvate carboxyltransferase  41.08 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4270  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.65 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  43.35 
 
 		 320 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0806  pyruvate carboxyltransferase  43.75 
 
 		 325 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0313  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.07 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  42.8 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  40.21 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  41.28 
 
 		 332 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.18 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  41.52 
 
 		 329 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2773  pyruvate carboxyltransferase  42.55 
 
 		 313 aa  188  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  40.48 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3394  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase, putative  42.11 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.461441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.24 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  41.89 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6613  pyruvate carboxyltransferase  41.61 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  37.27 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.05 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.49 
 
 		 326 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.77 
 
 		 326 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2780  pyruvate carboxyltransferase  41.22 
 
 		 301 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  0.241199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.59 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.19 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2695  pyruvate carboxyltransferase  43.53 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.54 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0049  pyruvate carboxyltransferase  41.73 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.21 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  36.9 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.93 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  39.53 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  42.12 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6309  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.18 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2345  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.18 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.511724  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.96 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2959  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.18 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.504237  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.4 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>