More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2762 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2762  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 329 aa  669    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5348  pyruvate carboxyltransferase  60.07 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4804  pyruvate carboxyltransferase  60.73 
 
 		 328 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5396  pyruvate carboxyltransferase  60.4 
 
 		 328 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5465  pyruvate carboxyltransferase  60.07 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0487859  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4807  pyruvate carboxyltransferase  60 
 
 		 328 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3685  pyruvate carboxyltransferase  58.82 
 
 		 744 aa  358  9e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0455  pyruvate carboxyltransferase  57.52 
 
 		 313 aa  352  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  56.21 
 
 		 729 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2967  pyruvate carboxyltransferase  55.7 
 
 		 331 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0445  pyruvate carboxyltransferase  58.09 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2695  pyruvate carboxyltransferase  54.25 
 
 		 314 aa  305  7e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2490  pyruvate carboxyltransferase  53.87 
 
 		 323 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.387658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2559  pyruvate carboxyltransferase  51.16 
 
 		 302 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2061  pyruvate carboxyltransferase  52.67 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3143  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  53.2 
 
 		 323 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3394  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase, putative  50.83 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.461441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.84 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0402015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0036  pyruvate carboxyltransferase  51.85 
 
 		 312 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.700183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1756  pyruvate carboxyltransferase  51.67 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6613  pyruvate carboxyltransferase  50.84 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6280  pyruvate carboxyltransferase  50.33 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5984  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 313 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4194  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.11 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0806  pyruvate carboxyltransferase  49.83 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6961  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.34 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6248  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.16 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1123  pyruvate carboxyltransferase  50.99 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0217211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3137  pyruvate carboxyltransferase  48.15 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676555  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0438  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 		 314 aa  248  9e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  45.55 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.41 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0233  pyruvate carboxyltransferase  44.44 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  43.33 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  42.05 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  40.74 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.47 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  45.49 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  44.04 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.07 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.82 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  43.01 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  40.41 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.84 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  42.25 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  42.61 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  42.62 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  41.9 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  42.47 
 
 		 309 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.5 
 
 		 336 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  42.86 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  44.04 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  41.55 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  41.52 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.14 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  41.88 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.24 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  43.05 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  44.04 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  41.4 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.05 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  41.11 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  39.34 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.93 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.93 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.93 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.93 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.93 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.27 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  44.12 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.26 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  41.04 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  41.88 
 
 		 331 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  42.26 
 
 		 308 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.6 
 
 		 303 aa  205  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.6 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.99 
 
 		 299 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1922  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.27 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  39.66 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1940  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.98 
 
 		 304 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.307176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  43.93 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.27 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  38.97 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.54 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  39.58 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.46 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2317  pyruvate carboxyltransferase  41.92 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0819697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  38.87 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.99 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  38.87 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  41.47 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  38.87 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  41.24 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  44.67 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.23 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.14 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3293  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.99 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1715  pyruvate carboxyltransferase  38.81 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2850  pyruvate carboxyltransferase  38.52 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2776  pyruvate carboxyltransferase  40.66 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>