More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4194 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4194  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  100 
 
 		 321 aa  628  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2762  pyruvate carboxyltransferase  48.11 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4804  pyruvate carboxyltransferase  49.18 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5396  pyruvate carboxyltransferase  49.18 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615332  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5348  pyruvate carboxyltransferase  48.41 
 
 		 333 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4807  pyruvate carboxyltransferase  48.01 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5465  pyruvate carboxyltransferase  48.85 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0487859  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.08 
 
 		 729 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.014296  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0445  pyruvate carboxyltransferase  49.03 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3685  pyruvate carboxyltransferase  49.17 
 
 		 744 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2967  pyruvate carboxyltransferase  48.5 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0455  pyruvate carboxyltransferase  46.08 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0806  pyruvate carboxyltransferase  44.22 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2490  pyruvate carboxyltransferase  44.37 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.387658  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2061  pyruvate carboxyltransferase  41.01 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0036  pyruvate carboxyltransferase  43.62 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.700183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3143  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.38 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3394  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase, putative  42.43 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.461441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2559  pyruvate carboxyltransferase  40.53 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.2 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0402015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6613  pyruvate carboxyltransferase  38.89 
 
 		 319 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2695  pyruvate carboxyltransferase  40.4 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6280  pyruvate carboxyltransferase  40.52 
 
 		 313 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1756  pyruvate carboxyltransferase  41.14 
 
 		 315 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5984  pyruvate carboxyltransferase  40.2 
 
 		 313 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6248  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.35 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938402  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6961  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.2 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1123  pyruvate carboxyltransferase  39.02 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0217211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3137  pyruvate carboxyltransferase  38.38 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676555  normal  0.0546823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0438  pyruvate carboxyltransferase  40.85 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  33.99 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  37.33 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  34.34 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  37.59 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.33 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  32.75 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  34.77 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  35.14 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  34.29 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  36.26 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.86 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  34.02 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.16 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3564  pyruvate carboxyltransferase  33.21 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  36.3 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  35.66 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.3 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1442  pyruvate carboxyltransferase  34.15 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306479  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2317  pyruvate carboxyltransferase  37.11 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0819697 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  33.11 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.15 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  33.68 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  33.92 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3976  pyruvate carboxyltransferase  38.23 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0304522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.97 
 
 		 299 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  33.79 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  32.62 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5035  pyruvate carboxyltransferase  37.04 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1378  pyruvate carboxyltransferase  34.15 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869565  normal  0.11843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  35.25 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  33.33 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  34.84 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  34.21 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  34.55 
 
 		 311 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0153  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  31.34 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  36.51 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  33.87 
 
 		 327 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4270  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  32.85 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0440  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  32.49 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  35.9 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  33 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  33.33 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  33.33 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.62 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  33.65 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  32.06 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  33.33 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  31.65 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  32.73 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.86 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2955  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  32.73 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  34.64 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0165  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  31.99 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  32.37 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  32.37 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  32.37 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  33.44 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2870  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  32.73 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.868536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  32.12 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3278  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  33.92 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1922  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.91 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  35.86 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  36.15 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3007  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  32.37 
 
 		 310 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.868623  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  32.07 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  35.96 
 
 		 313 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  28.47 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  28.47 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  33.45 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  31.82 
 
 		 302 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>