More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1894 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1894  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 301 aa  583  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4466  pyruvate carboxyltransferase  89.04 
 
 		 301 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1558  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  82.72 
 
 		 301 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.953041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1588  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  82.72 
 
 		 301 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1612  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  82.72 
 
 		 301 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5035  pyruvate carboxyltransferase  60.34 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4266  pyruvate carboxyltransferase  59.8 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0273285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  49.33 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  50.51 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  49.15 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  50.51 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.83 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  43.2 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4878  pyruvate carboxyltransferase  41.84 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.980177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3515  pyruvate carboxyltransferase  43.34 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1472  pyruvate carboxyltransferase  38.13 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  39.59 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.31 
 
 		 297 aa  221  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5092  pyruvate carboxyltransferase  42.71 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.596578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  43.06 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3870  pyruvate carboxyltransferase  43.4 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  0.779005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  36.82 
 
 		 299 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25990  HMG-CoA lyase-like protein  40.41 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0762  pyruvate carboxyltransferase  37.04 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2107  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.85 
 
 		 326 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483824  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0968  pyruvate carboxyltransferase  42.61 
 
 		 307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1554  pyruvate carboxyltransferase  39.38 
 
 		 325 aa  211  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1303  pyruvate carboxyltransferase  40 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.254964  hitchhiker  0.0013896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2875  pyruvate carboxyltransferase  38.91 
 
 		 329 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6976  pyruvate carboxyltransferase  40.28 
 
 		 318 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3719  pyruvate carboxyltransferase  41.38 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4162  pyruvate carboxyltransferase  40.74 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1315  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.93 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5024  pyruvate carboxyltransferase  39.1 
 
 		 311 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.37 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1664  pyruvate carboxyltransferase  36.79 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2358  pyruvate carboxyltransferase  37.2 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4037  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  38.14 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588205  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1213  pyruvate carboxyltransferase  36.79 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1692  pyruvate carboxyltransferase  36.79 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.03 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  33.67 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.69 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2658  pyruvate carboxyltransferase  38.23 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4523  pyruvate carboxyltransferase  43.96 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278564  normal  0.113304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3976  pyruvate carboxyltransferase  41.55 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0304522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1600  pyruvate carboxyltransferase  37.46 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4853  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.59 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.35 
 
 		 303 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.69 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.69 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05477  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.64 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.69 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0873  pyruvate carboxyltransferase  36.77 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000000264563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1697  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  41.78 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00979317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.69 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4250  pyruvate carboxyltransferase  41.16 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.69 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.64 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  38.74 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1652  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.27 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  34.35 
 
 		 303 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2729  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.41 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2871  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.67 
 
 		 327 aa  198  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1622  pyruvate carboxyltransferase  36.79 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  40.27 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4199  pyruvate carboxyltransferase  43.36 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3494  pyruvate carboxyltransferase  37.95 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  34.69 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3092  pyruvate carboxyltransferase  37.67 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal  0.0987671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  38.41 
 
 		 315 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2490  pyruvate carboxyltransferase  40.54 
 
 		 323 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.387658  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3143  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.54 
 
 		 323 aa  195  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0918895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5984  pyruvate carboxyltransferase  40.67 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0177  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.18 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  39.6 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6280  pyruvate carboxyltransferase  40.67 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  34.35 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  39.39 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000381  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  35.77 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0594  pyruvate carboxyltransferase  38.98 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.528974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3506  pyruvate carboxyltransferase  36.86 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2124  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  37.84 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.365673  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3267  pyruvate carboxyltransferase  36.43 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705038  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  39.42 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1232  pyruvate carboxyltransferase  37.04 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.26 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.4 
 
 		 327 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0402015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0049  pyruvate carboxyltransferase  38.21 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0293  pyruvate carboxyltransferase  38.1 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2390  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  39.25 
 
 		 303 aa  191  9e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2773  pyruvate carboxyltransferase  40.28 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1146  pyruvate carboxyltransferase  40.47 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  39.46 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0036  pyruvate carboxyltransferase  41.3 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.700183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5396  pyruvate carboxyltransferase  39.31 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615332  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0961  pyruvate carboxyltransferase  42.42 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  38.05 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6617  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  40.75 
 
 		 319 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.567308  normal  0.390132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2780  pyruvate carboxyltransferase  38.11 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  0.241199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>