99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0913 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 310 aa  633  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  44.44 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  46.6 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  31.41 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  32.8 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  28.3 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  28.27 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  28.25 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  29.08 
 
 		 302 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  30.56 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  29.65 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  28.44 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  26.77 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  30 
 
 		 325 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  28.26 
 
 		 318 aa  85.5  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  28.24 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  27.27 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  28.48 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  28.31 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  29.3 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  27.27 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.8 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  23.95 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.23 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  25.67 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.94 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  24.42 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  25.23 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  26.15 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.84 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.24 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  25.33 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.37 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1974  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.52 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  27.14 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  25.25 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  23.22 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.11 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.44 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  26.87 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  24.86 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.69 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.25 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  24.06 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  24.06 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  24.58 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.1 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  27.01 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.52 
 
 		 447 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.57 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  22.64 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  23.58 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.64 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.06 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.86 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  20.91 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  20.99 
 
 		 456 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.41 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  28.19 
 
 		 502 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0912  hypothetical protein  29.07 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.524803  normal  0.0295482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  23.53 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  23.62 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  22.43 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  20.99 
 
 		 459 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  24.1 
 
 		 266 aa  46.6  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  23.11 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.43 
 
 		 302 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.43 
 
 		 302 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.33 
 
 		 447 aa  45.8  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  26.15 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  22.17 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.96 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.12 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  23.85 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.16 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.56 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  21.76 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5406  glutathione synthase  32.62 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  25.9 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  28.16 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  21.89 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.29 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  21.6 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  20.55 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  21.86 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  22.75 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.66 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  25 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  23.23 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.18 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.18 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  28.26 
 
 		 340 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.18 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  24.46 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  23.31 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  21.76 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  32.96 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.12 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  26.46 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>