21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2528 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  30.28 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  28.05 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  31.19 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  33.07 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  32.93 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  32.06 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  24.71 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  25.34 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  27.17 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  24.73 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  30.68 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  29.53 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  25.38 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  28.33 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  24.13 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  27.5 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  24.73 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  26.53 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  29.37 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>