42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1753 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 
313 aa  604  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  93.29 
 
 
313 aa  567  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  79.23 
 
 
313 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.53 
 
 
339 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.23 
 
 
313 aa  146  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  35.44 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.58 
 
 
318 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  31.48 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.96 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  33.33 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  36.43 
 
 
321 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  30.34 
 
 
328 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  31.58 
 
 
316 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  28.12 
 
 
327 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  31.69 
 
 
324 aa  122  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  31.41 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  34.49 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  36.67 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  32.55 
 
 
328 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  27.3 
 
 
320 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  30.36 
 
 
320 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  30.37 
 
 
319 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  30.98 
 
 
319 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.36 
 
 
367 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  25.76 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  27.6 
 
 
352 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  31.47 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  30.95 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  29.23 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.23 
 
 
324 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  30.7 
 
 
639 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  25.86 
 
 
262 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  28.24 
 
 
292 aa  46.6  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.23 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  25.23 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  25.23 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  30.77 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  26.51 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  24.77 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  24.77 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.35 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  27.98 
 
 
301 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>