33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0610 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  678    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  36.08 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  33.84 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  33.03 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.43 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  31.03 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  32.6 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.91 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  30.82 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  28.66 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.75 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  31.71 
 
 		 327 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  29.94 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  30.75 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  31.38 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  30.43 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  34.46 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  30.09 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.58 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  31.69 
 
 		 313 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  31.79 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.21 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  25.87 
 
 		 307 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  24.84 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  27.3 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  28.08 
 
 		 639 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  25.23 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  29.61 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  25.22 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.24 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  27.5 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.37 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  26.12 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>