38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1840 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 313 aa  643    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  33.23 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  33.23 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  29.85 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.69 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.83 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  30 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  31.94 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  30.58 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  35.37 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  30.84 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  29.72 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  28.3 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  30.11 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  29.38 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  28.87 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  29.56 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  29.54 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  27.33 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  31.31 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  33.33 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  29.17 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  26.15 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  31.98 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  32.54 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  26.85 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  31.43 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  29.65 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  25.42 
 
 		 639 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  23.45 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  26.48 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.86 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.91 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.91 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  27.69 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  26.1 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>