42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3330 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 311 aa  618  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  51.59 
 
 		 318 aa  288  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  45.81 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  46.35 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  43.35 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  41.19 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  34.91 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  32.17 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  36.42 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  34.08 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.03 
 
 		 339 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  32.92 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  31.7 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.59 
 
 		 313 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  33.44 
 
 		 325 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  30.39 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  37.96 
 
 		 313 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  38.15 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  33.77 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  27.41 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  34.77 
 
 		 313 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  27.41 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.48 
 
 		 367 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  26.22 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  33.08 
 
 		 309 aa  89.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  29.22 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  26.56 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  25.23 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  27.45 
 
 		 639 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.94 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.77 
 
 		 447 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0657  RimK domain protein ATP-grasp  29.95 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  29.38 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.62 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  29.23 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.62 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  27.59 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  27.54 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1836  glutathione synthetase  29.23 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.88 
 
 		 295 aa  42.7  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.39 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1904  glutathione synthetase  26.92 
 
 		 320 aa  42.4  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>