27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0690 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  100 
 
 		 639 aa  1257    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  27.64 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.07 
 
 		 318 aa  62  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  23.51 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24190  hypothetical protein  43.48 
 
 		 75 aa  58.2  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  24.58 
 
 		 320 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  25.24 
 
 		 339 aa  53.9  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2244  type IV pilus assembly PilZ  39.02 
 
 		 1416 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.35167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  30.4 
 
 		 313 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  30.34 
 
 		 971 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  26.36 
 
 		 319 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  27.48 
 
 		 319 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  21.28 
 
 		 307 aa  50.4  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  25.42 
 
 		 313 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1612 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41316  predicted protein  35.71 
 
 		 380 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  25.97 
 
 		 2179 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  33.33 
 
 		 2914 aa  48.1  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  23.48 
 
 		 325 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  29.84 
 
 		 325 aa  48.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  30.7 
 
 		 313 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  25.25 
 
 		 325 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  27.22 
 
 		 311 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  27.68 
 
 		 318 aa  47.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1390  heme exporter protein D  41.07 
 
 		 120 aa  45.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  23.86 
 
 		 319 aa  44.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  25.84 
 
 		 316 aa  44.3  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>