33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1806 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  650    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  47.95 
 
 		 325 aa  286  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  46.33 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  46.2 
 
 		 318 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  45.81 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  42.59 
 
 		 321 aa  232  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  36.59 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.7 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  31.38 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  34.7 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  34.06 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  31.33 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  33.64 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  31.86 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  31.58 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  29.06 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  31.08 
 
 		 313 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  33.33 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  28.43 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  27.13 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  29.54 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  27.64 
 
 		 328 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  30.33 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  26.59 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.53 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  30.24 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  28.48 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  25.49 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  25.84 
 
 		 639 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  26.4 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.88 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.88 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.33 
 
 		 447 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>