28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1618 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  680    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  57.23 
 
 
325 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  37.27 
 
 
328 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  33.85 
 
 
325 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.79 
 
 
339 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  29.41 
 
 
320 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  31.71 
 
 
324 aa  142  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.7 
 
 
311 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  27.73 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  29.38 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  29.54 
 
 
320 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  29.47 
 
 
319 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.87 
 
 
318 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  29.06 
 
 
316 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  28.75 
 
 
318 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  28.12 
 
 
313 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  29.19 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  29.5 
 
 
319 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  27.61 
 
 
352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.11 
 
 
313 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  26.73 
 
 
307 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  28.48 
 
 
319 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  27.55 
 
 
367 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  26.79 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  24.42 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  25.35 
 
 
328 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  25.11 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  23.71 
 
 
333 aa  49.7  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>