48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4917 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 318 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  50 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  46.2 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  44.3 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  46.84 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  42.01 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  35.28 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  35.08 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  32.28 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  32.91 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  33.75 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  36.76 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  35.83 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  35.11 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  33.13 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.89 
 
 		 339 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  35.56 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  31.87 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  28.48 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  30.47 
 
 		 352 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  29.72 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  26.65 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  28.26 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.03 
 
 		 367 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  30.15 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  27.84 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  28.57 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  24.69 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  31.07 
 
 		 639 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.19 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.67 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  24.32 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  25.58 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  25.88 
 
 		 265 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.96 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  25.84 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.84 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.84 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.49 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  23.85 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.06 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  22.17 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  26.67 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.86 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  28.87 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.33 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  30.56 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>