93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1722 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 320 aa  653    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  57.69 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  54.81 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  33.44 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  31.86 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  32.61 
 
 		 318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.28 
 
 		 318 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.17 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  29.36 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  28.08 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  28.66 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  29.72 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  31.01 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  28.62 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  30.55 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  28.26 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  28.21 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  28.75 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  28.35 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  26.96 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  27.25 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  28.09 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  25.95 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  27.24 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  21.94 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  24.46 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  22.32 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  29.27 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  26.7 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.21 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  27.49 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  21.92 
 
 		 282 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.96 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  32.91 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  22.12 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  24.07 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  22.86 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.15 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  23.04 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.75 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  23.79 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  24.54 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.4 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  25.73 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.48 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  25.58 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  24.52 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  23.08 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.58 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.78 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.07 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  23.3 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  20.87 
 
 		 301 aa  45.8  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  23.56 
 
 		 459 aa  45.8  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  22.6 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  22.33 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  23.11 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  25.47 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  24.64 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  25.6 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  24.73 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  23.79 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  24.64 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  24.55 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  24.15 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  26.32 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  26.32 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  26.32 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  26.32 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  26.32 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  22.6 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  20.56 
 
 		 639 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.64 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.15 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  26.79 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  22.6 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.15 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  21.6 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0305  carbamoyl phosphate synthase large subunit  35.16 
 
 		 1089 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  25.36 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  23.56 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  23.56 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  26.67 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  26.67 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.15 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  26.67 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  26.67 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.6 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  26.67 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  22.6 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.67 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  26.67 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>