46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2651 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  655    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  64.78 
 
 		 319 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  57.69 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  31.5 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  32.6 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.13 
 
 		 339 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.08 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  34.8 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  30.03 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.13 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  34.06 
 
 		 316 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  30 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  29.47 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  28.88 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  29.34 
 
 		 307 aa  119  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  32.44 
 
 		 328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  31.34 
 
 		 352 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  29.97 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  30.86 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  25.9 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  30.37 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.54 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  32.02 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  30.11 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  28.45 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  26.15 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  30.1 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  27.48 
 
 		 639 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  25.66 
 
 		 333 aa  52.8  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  28.57 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  23.74 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  25.68 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  24.37 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  25.98 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  25.23 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  24.37 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  28.3 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.88 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  23.88 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  23.88 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.56 
 
 		 447 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.15 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.3 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.3 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  23.51 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>