47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1948 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  655    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  33.44 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  32.72 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  31.5 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  30.43 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  31.5 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  30.91 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  29.54 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.56 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  28.48 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  28.62 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  28.26 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  27.41 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  27.41 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  30.27 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  30.36 
 
 		 313 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  27.13 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  27.33 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  23.57 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  27.22 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  26.98 
 
 		 352 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  25.23 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  26.77 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  28.1 
 
 		 313 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  29.7 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  24.66 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.75 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  27.16 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  26.11 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  24.58 
 
 		 639 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  25.81 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30 
 
 		 447 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.63 
 
 		 271 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1974  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.26 
 
 		 414 aa  50.1  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  23.15 
 
 		 266 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  25.54 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  20.29 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.48 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.78 
 
 		 447 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.7 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  20.29 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  23.38 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  20.1 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>