45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5450 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 325 aa  660    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  47.95 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  46.98 
 
 		 318 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  44.3 
 
 		 318 aa  255  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  42.04 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  42.99 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  30.65 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  27.62 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  33.23 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  36.28 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  29.15 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  35.44 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  29.94 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  30.38 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  34.08 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.9 
 
 		 339 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  30 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  27.73 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  28.26 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  29.88 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.84 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  24.92 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  24.76 
 
 		 307 aa  92.8  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.11 
 
 		 367 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  27.27 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  28.12 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  23.66 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  25.84 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  26.61 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.05 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  28.77 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  29.84 
 
 		 639 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  26.17 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  26.18 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.75 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.42 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  26.18 
 
 		 301 aa  46.6  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0629  D-ala D-ala ligase  23.7 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  25.35 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.1 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  25.11 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.58 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  26.19 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.39 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  26.98 
 
 		 292 aa  42.7  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>