97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4961 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  671    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  41.23 
 
 
309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  44.44 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  29.52 
 
 
313 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  32.55 
 
 
313 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  27.34 
 
 
333 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  28.87 
 
 
313 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  31.19 
 
 
302 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  27.64 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  27.22 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  34.36 
 
 
328 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.58 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  31.6 
 
 
313 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  27.3 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  26.83 
 
 
325 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  24.43 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  30.5 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  26.91 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  26.16 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  23.66 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  29.47 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  24.54 
 
 
321 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.16 
 
 
324 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  27.4 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  24.82 
 
 
318 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.1 
 
 
295 aa  62.8  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  25.35 
 
 
327 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  28.5 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  26.7 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  26.53 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  30.1 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.12 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.62 
 
 
267 aa  55.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.33 
 
 
447 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  29.29 
 
 
267 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  28.77 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  23.67 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1974  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.15 
 
 
414 aa  53.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  24.88 
 
 
324 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  22.54 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1505  alpha-L-glutamate ligase  25.67 
 
 
285 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  26.42 
 
 
264 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1170  alpha-L-glutamate ligase  25.27 
 
 
285 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  normal  0.722984 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  27.27 
 
 
285 aa  49.7  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.83 
 
 
447 aa  49.7  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.79 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0780  alpha-L-glutamate ligase  25.67 
 
 
285 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  21.57 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  26.46 
 
 
292 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.4 
 
 
299 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  22.38 
 
 
286 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.63 
 
 
288 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  31.43 
 
 
300 aa  46.2  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  26.32 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.56 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  31.93 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  25.13 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  28.95 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  22.79 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  20.95 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.63 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  27.05 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.73 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  23.33 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  27.07 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  23.33 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  29.7 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  25.65 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  31.68 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  23.56 
 
 
329 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  25.12 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.11 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.63 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  23.68 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.74 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  30.08 
 
 
342 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  29.41 
 
 
323 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  29.41 
 
 
323 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  27.87 
 
 
292 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  29.84 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  20.85 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  29.84 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  29.84 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  29.84 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  29.84 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.81 
 
 
328 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  26.81 
 
 
328 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.91 
 
 
327 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  26.81 
 
 
328 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  29.7 
 
 
306 aa  43.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  29.7 
 
 
306 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.91 
 
 
327 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  19.57 
 
 
307 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  27.84 
 
 
292 aa  42.7  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  22.77 
 
 
309 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  26.81 
 
 
328 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.7 
 
 
292 aa  42.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>