41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1835 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  79.23 
 
 		 313 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  77.96 
 
 		 313 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  34.39 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.67 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.7 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.12 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  33.02 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  32.41 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  31.02 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  34.62 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.16 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  32.94 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  27.83 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  26.79 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  31.43 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  35.98 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  30.56 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.75 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  32.39 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  28.1 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  32.02 
 
 		 319 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  27.36 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  25.87 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  27.95 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  30.79 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  28.4 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  30.62 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  27.69 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.85 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  26.34 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  28.8 
 
 		 639 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.37 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  28.04 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  25.37 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  25.37 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  26.83 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  24.88 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  24.4 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  24.88 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  25.37 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>