37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0325 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 325 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  57.23 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  38.87 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  35.09 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.97 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  28.66 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  33.23 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  33.44 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.11 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  31.5 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  28.88 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  31.86 
 
 		 316 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.44 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  32.82 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  33.33 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  32.92 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  28.88 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.37 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  29.91 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  32.94 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  28.52 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  27.78 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  30 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  22.87 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  29.23 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  30.5 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  25 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  28.04 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  27.05 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  26.07 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  23.48 
 
 		 639 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  26.05 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.67 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.59 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  25.12 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  25.6 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.56 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>