32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2122 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  93.29 
 
 
313 aa  567  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  77.96 
 
 
313 aa  447  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.23 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  36.28 
 
 
325 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.28 
 
 
339 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.51 
 
 
318 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  32.41 
 
 
325 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  33.65 
 
 
321 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  29.38 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  32.92 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  34.46 
 
 
324 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  38.15 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  32.92 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  31.27 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  34.49 
 
 
318 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  32.8 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  29.52 
 
 
328 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  34.55 
 
 
309 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  30.27 
 
 
320 aa  105  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  30.86 
 
 
319 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  27.59 
 
 
320 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  27.65 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  30.89 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.64 
 
 
367 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  28.19 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  30.98 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  32.2 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  25.27 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  30.59 
 
 
639 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.75 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  25.86 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>