45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5021 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 
339 aa  695    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  38.56 
 
 
328 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  31.79 
 
 
327 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  33.43 
 
 
324 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  36.11 
 
 
319 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.03 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  33.13 
 
 
319 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  29.05 
 
 
320 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  35.47 
 
 
318 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  35.22 
 
 
316 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  35.53 
 
 
313 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  31.97 
 
 
325 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  31.2 
 
 
352 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  34.28 
 
 
313 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.89 
 
 
318 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.83 
 
 
313 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  31.9 
 
 
325 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  30.56 
 
 
320 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  33.12 
 
 
313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  32 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  27.8 
 
 
307 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.61 
 
 
367 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  29.06 
 
 
319 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  28.27 
 
 
310 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  33.49 
 
 
309 aa  99  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  30.58 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  29.95 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  25.24 
 
 
639 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  25.75 
 
 
299 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  25.93 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  29.53 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.88 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.9 
 
 
283 aa  49.3  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.73 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.03 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.44 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  25.59 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  24.06 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.67 
 
 
287 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  26.64 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.48 
 
 
302 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  24.76 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  23.81 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  24.71 
 
 
293 aa  42.7  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>