27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1829 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  733    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  31.04 
 
 
328 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.2 
 
 
339 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  30.75 
 
 
324 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.77 
 
 
311 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.47 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  29.88 
 
 
325 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  29.63 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  31.34 
 
 
319 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  27.61 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  28.62 
 
 
319 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  34.33 
 
 
318 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  25.45 
 
 
325 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  28.52 
 
 
325 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  26.98 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  28.19 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  26.15 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  30.25 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  27.6 
 
 
313 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  28.82 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  24.43 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  26.7 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  28.4 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  24.9 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  27.62 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  23.55 
 
 
319 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  25.33 
 
 
310 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>