43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0326 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0326  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 328 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.967856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1619  hypothetical protein  57.14 
 
 		 325 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0869358  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1618  hypothetical protein  37.27 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0803612  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0325  RimK domain protein ATP-grasp  38.87 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5021  RimK domain-containing protein ATP-grasp  38.56 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0610  hypothetical protein  33.03 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1806  hypothetical protein  36.59 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4917  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.08 
 
 		 318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278599  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0192  hypothetical protein  32.71 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5450  RimK domain protein ATP-grasp  30.65 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2425  hypothetical protein  34.16 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0304721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3330  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.81 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1829  hypothetical protein  31.04 
 
 		 352 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1840  RimK domain-containing protein ATP-grasp  29.85 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1948  hypothetical protein  30.91 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2122  hypothetical protein  32.92 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451031  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1722  RimK domain protein ATP-grasp  27.81 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.841906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1753  RimK domain protein ATP-grasp  30.34 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3706  hypothetical protein  32.81 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2651  hypothetical protein  32.44 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1835  RimK domain protein ATP-grasp  31.02 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4350  RimK domain-containing protein ATP-grasp  29.63 
 
 		 367 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0913  RimK domain protein ATP-grasp  28.25 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0496  hypothetical protein  27.3 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2877  hypothetical protein  26.09 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4961  hypothetical protein  34.36 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2371  RimK domain protein ATP-grasp  25 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646066  decreased coverage  0.000117185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2528  hypothetical protein  24.24 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03513  hypothetical protein  25.63 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  23.51 
 
 		 639 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  22.85 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  19.82 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.43 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  20.61 
 
 		 266 aa  46.2  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  22.5 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2282  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.51 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.71 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2370  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1581  S6 modification enzyme RimK  25.51 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.683283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  21.67 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  23.56 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  22.86 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.87 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>