267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5406 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5406  glutathione synthase  100 
 
 		 323 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2324  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3299  glutathione synthetase  41.59 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4010  glutathione synthetase  39.08 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1836  glutathione synthetase  41.56 
 
 		 324 aa  248  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4048  glutathione synthetase  39.08 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  42.5 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1904  glutathione synthetase  42.39 
 
 		 320 aa  241  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4206  glutathione synthetase  38.32 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  37.74 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01961  glutathione synthetase  35.85 
 
 		 308 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.072282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02531  glutathione synthetase  35.22 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1546  glutathione synthetase  34.91 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0049  glutathione synthetase  40 
 
 		 317 aa  202  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0437692 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  38.61 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  35.85 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  38.36 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0935  glutathione synthetase  39.55 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.263345  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0217  glutathione synthetase  35.22 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  36.96 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  34.69 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  35.08 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  35.85 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  35.53 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  34.69 
 
 		 316 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  37.11 
 
 		 322 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  33.02 
 
 		 316 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  34.28 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  34.46 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2409  glutathione synthase  39.31 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  34.58 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  34.28 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  34.28 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  34.28 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  34.28 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  34.28 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  36.02 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  33.96 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0259  glutathione synthetase  36.79 
 
 		 318 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  33.96 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  37.89 
 
 		 314 aa  192  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  34.69 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  33.65 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  34.16 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  33.96 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  33.65 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  35.42 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  33.65 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  35 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  36.79 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  36.79 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  36.79 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6192  glutathione synthetase  36.79 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  36.79 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  37.65 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  38.82 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  36.79 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  36.79 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  36.79 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  37.11 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  37.54 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  37.27 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  38.8 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2874  glutathione synthetase  37.11 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.235828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  35.96 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  37.3 
 
 		 320 aa  189  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02071  glutathione synthetase  31.66 
 
 		 307 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  35.86 
 
 		 319 aa  188  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  33.96 
 
 		 317 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  31.76 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27361  glutathione synthetase  36.79 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  33.02 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  36.65 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01601  glutathione synthetase  36.16 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  36.48 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  34.69 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  39.12 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  33.54 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01981  glutathione synthetase  30.41 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0769022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0440  glutathione synthetase  36.16 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  34.8 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01961  glutathione synthetase  30.09 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  34.91 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  36.59 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4539  glutathione synthetase  39.19 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  39.09 
 
 		 312 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>